要以大江大河大湖、大运河、山区河道、中央直管河湖、南水北调中线干线工程交叉河道等为重点，纵深推进全国水利普查名录内河湖（无人区除外）“四乱”问题清理整治，并向农村河湖延伸。
农村黑臭水体所在河湖的河湖长要切实履行责任，调动各方密切配合，协调联动，推动农村河湖黑臭水体治理到位。
划定九大高原湖泊生态廊道线及环湖公路，完善截污管网；全面推动河长制从“有名有责”向“有能有效”转变，将清理整治重点向中小河流、农村河湖延伸。
同时，启动“绿水行动之创建幸福河湖”，以高压态势控制非法采砂，稳步推进“清五乱”，强化城镇生活污水处理监管，综合治理农村河湖水系，逐步消减农业面源对河流的污染，全面规范禽畜养殖，强化河湖和水土保持监管，
随着工作的推进，整治范围逐步由大江大河大湖向中小河流、农村河湖延伸，2019年全年共清理整治河湖“四乱”问题13.7万个，各地河湖面貌明显改善，目前该项工作仍在持续进行中。...4.河湖“清四乱”专项行动2018年7月，水利部部署开展全国河湖“清四乱”（乱占、乱采、乱堆、乱建）专项行动，重点整治非法建设、非法围河围湖、非法采砂、农村河湖脏乱差、非法种植养殖等问题。
《意见》强调，检察机关要积极督促相关行政主管部门健全农村水环境综合治理体制机制，助推村庄（游牧民定居点）生活污水直排问题得到有效解决；持续加强对黄河青海流域干支流、农村河湖的全面清理整治，切实解决涉河湖违规建设
在实施农村河湖水环境整治中，全面掌握管辖河湖存在问题。...近年来，江苏泗阳县以全面深化落实河长制为契机，有条不紊推进农村河湖水环境整治，紧紧围绕“河畅、水清、岸绿、景美”的目标，加大水环境治理，全县水生态、水环境面貌得到明显改善。“绿水青山就是金山银山”。
将农村河湖水系打造成“安全的河、生态的河、美丽的河”。...湖南省津市市水利局党组书记、局长聂宇介绍，通过水系连通及农村水系综合整治后，预计2021年底，全市将实现“七河八湖共联动，固岸治水河湖通”的目标，基本建成水美乡村；通过持续改革创新农村河湖管护长效机制，
三是加强河湖生态修复保护，开展河道清障和清淤疏浚工作，新建生态护岸，改建加固堤防，综合治理滨岸带，着力解决农村河湖功能衰减、水域岸线侵占和水环境恶化等问题。
清理整治要不留死角、不留空白，既包含大江大河，也包含中小河流、农村河湖，要盯住“大块头”“硬骨头”，重点整治非法建设、非法围河围湖、非法采砂以及农村河湖脏乱差、非法种植养殖等问题。
为加强农村河湖治理管护，第5号总河长令明确，要以农村面源污染综合整治为重点，坚决遏制农村河湖水污染多发重发趋势；以农村河湖水系综合治理、系统治理为重点，加快改善农村河湖整体面貌；以保洁清洁为重点，尽快彻底解决农村河湖
开展协同治理，推动城镇污水处理设施和服务向农村延伸，加强改厕与农村生活污水治理的有效衔接，实现农村河湖河长湖长全覆盖，发挥河长湖长对农村水环境保护治理的协调作用。
江西要求，加强农村河湖渠塘管理保护和水利工程管理水平，有效遏制乱占乱建、乱围乱堵、乱采乱挖、乱倒乱排等现象，强化农田水利基础设施管护，建立健全权责明确、投入多元、建设有序、运行长效、管理和服务到位的农田水利建设与运行管理体制机制保障体系
对城市河湖，要处理好开发利用与生态保护的关系，划定河湖管理保护范围，加大黑臭水体治理力度，着力维护城市水系完整性和生态良好;对农村河湖，要加强清淤疏浚、环境整治和水系连通，狠抓生活污水和生活垃圾处理，保护和恢复河湖的生态功能
对城市河湖，要处理好开发利用与生态保护的关系，划定河湖管理保护范围，加大黑臭水体治理力度，着力维护城市水系完整性和生态良好;对农村河湖，要加强清淤疏浚、环境整治和水系连通，狠抓生活污水和生活垃圾处理，保护和恢复河湖的生态功能
